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浙江突破AI诊断技术疑似病例基因分析缩至半小时

针对新型冠状病毒的AI诊断技术,将在浙江大规模应用!2月1日,浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台。利用阿里达摩院研发的AI算法,可将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时,大幅缩短确诊时间,并能精准检测出病毒的变异情况。

当前,全国新型冠状病毒肺炎疫情依然严峻,快速、精确诊断对于疫情控制尤其重要。公开信息显示,该病毒是基因组序列最长的病毒之一,全基因组序列全长29847bp,临床诊断需要将患者样本与该病毒基因序列进行比对才能确定诊断结果。

疫情发生后,达摩院算法专家顾斐博士立即奔赴浙江省疾控中心,第一时间针对新型冠状病毒基因进行特征分析,并推出多个算法模型。在序列比对过程中,达摩院对算法增加了分布式设计,有效提升比对效率;在病毒序列拼接阶段使用分布式设计的de Bruijn图算法,变异病毒也能精准检测。

香格里拉青稞是高寒缺氧地区主要的食物和膳食纤维,多生长在海拔2800米以上地区。因而,自古以来,香格里拉青稞在迪庆人民群众生活中占有极其重要的地位,在迪庆藏族自治州已形成一定生产规模,是迪庆农业增效、农民增收的经济作物之一。

一些营销“末日商品”的商家也利用疫情提升了一把销量。通常这些“末日商品”包括收音机、手摇发电手电筒、滤水器、硬壳瓶装水等。“末日食品”则包括保质期长达25至30年的罐头食品等,而且一卖就是一个人一年的量。

青稞在中国高原地区具有悠久的栽培历史,主要分布在中国西藏、青海、云南迪庆州、四川的甘孜州和阿坝州。迪庆藏族自治州,是云南省的8个自治州之一,首府香格里拉市,藏语意为“吉祥如意的地方”。香格里拉青稞,是香格里拉的特产,同时也是中国农产品地理标志。

基于部分美国人“瘟疫导致资源紧张、资源紧张导致骚乱、骚乱只能自救”的判断,美国最近枪支弹药的销售量也出现了上涨,特别是子弹。美国一家在线销售枪支的网站统计显示,自今年2月下旬以来,几种常见口径的手枪子弹销售出现了95%至410%的增长。

虽然纽约州的这个“封城”只能算做了一半,州长科莫还是在媒体上进行了解释。他说:“确诊数字一直在上升,我们的确有必要给新罗谢尔市制定一个特殊的公共卫生战略。”

囤吃囤用囤子弹,“末日商品”也火了一把

许多中小学也因为在学校出现确诊病例而停课。位于纽约的联合国国际学校,由于一名老师确诊,从3月9日起停课至3月20日。

美国1月21日确诊首例新冠肺炎病例以来,在50多天时间里,疫情迅速蔓延。美国总统特朗普近日多次明示或暗示,新冠肺炎跟流感差不多,不值得如临大敌。这个说法不仅专家不同意,美国民众似乎也不相信。目前在美国各地,特别是疫情较为严重的地区,出现了民众囤积生活和防疫物资、学校停课、公众聚集活动推迟或取消等现象。3月10日,纽约州对一个近8万人口的小城实行管制,创下美国防疫“封城”的先河。

哈佛麻省等名校纷纷停课,学生将改上网课

浙江省疾控中心基因测序负责人孙逸博士表示:“该平台基于阿里云的强大算力与达摩院新算法可以为病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短时间内将检测范围覆盖整个确诊病例,也为后续疫苗与药物研发打下了坚实基础。”

(本报纽约3月11日专电)

下一步,香格里拉海关将统筹做好疫情防控和促进外贸稳增长各项工作,“一企一策”为迪庆州进出口企业量身定制服务措施,优化出口注册登记相关程序,帮扶迪庆州高原食品、农产品扩大出口。同时,香格里拉海关将积极主动对迪庆州生产生活所需进口物资提供审价、归类、减免税审核指导,助力迪庆州外贸稳步发展。

2月下旬以来,随着美国境内新冠病毒感染人数不断增加,民众开始囤积食品、药品等物资。早在1月下旬开始,口罩、消毒液等在美国市场上已经不太容易买到了。

美国国民警卫队进驻“封城”管制区

图为昆明海关所属香格里拉海关工作人员在验放啤酒。昆明海关供图

今年以来,受新冠肺炎疫情影响,香格里拉高原精酿啤酒有限公司的出口受到较大冲击,香格里拉海关了解到相关情况后,迅速统筹做好疫情期间促外贸稳增长工作,派出工作组深入企业调研,支持企业开展业务创新,提升迪庆青稞精酿啤酒在国际市场的竞争力,尽全力帮助企业恢复海外订单。

企业出口产品一经生产完成,香格里拉海关就派员下厂指导企业通过国际贸易“单一窗口”为出口啤酒办理网上无纸化申报,做到远程“不见面”审批,无纸化报关报检,帮助企业足不出户完成出口前的报关手续,最大程度为企业降低出口成本,提升报关效率。

疫情也影响到了教育行业。美国各地的大学,特别是疫情较为严重地区的大学,从3月上旬开始陆续停课,有的提前进入“春假”,春假后改上网课,有的直接改上网课。位于波士顿的哈佛大学和麻省理工学院3月10日发出通知,即日起暂停在学校授课,所有学生在3月15日前离开校园,3月23日“春假”结束后,所有学生改上网课。两所大学所在的马萨诸塞州目前有确诊病例92个,在全美50个州中排名第四。

目前医院普遍采用核酸检测方法,其只能检测到病毒基因的局部。由于病毒存在变异的可能性,对于整个基因序列来说这种检测方法犹如盲人摸象,一旦病毒发生变异,就可能出现漏检的情况。

浙江的全基因组检测分析平台由浙江省疾病预防控制中心、阿里达摩院医疗AI团队和杰毅生物技术公司共同研发。该平台采用不同于核酸检测方法的全基因组检测技术,对疑似病例的病毒样本进行全基因组序列分析比对,能够有效防止病毒变异产生的漏检,并将原需数小时的全基因分析流程减少到半小时,大幅提高疑似病例的确诊速度和准确率。

截至记者发稿时,纽约州现有确诊病例176例,有108例在西切斯特郡,其中又以大约有8万人口的新罗谢尔市最为集中。纽约州宣布的管制措施主要是在3月12日至25日期间,在新罗谢尔市方圆1英里的范围内关闭学校、宗教场所等,但不限制人员进出。政府安排国民警卫队进驻管制区,为区内民众提供食品、交通服务。纽约州还将在该市建一个病毒检测点,以减少疑似病例离开管制区。

美国第二大零售商和最大会员制仓储式超市开市客(COSTCO)由于商品量大价优,成为民众囤积物资的首选之地。美国各地的开市客门店平时周一至周五并没有多大人流量,但是最近一段时间总是人满为患,等待结账的队伍在店里绕了好几个弯,商品断货的情况时有发生。在美国社交媒体上,还有人分享疫情下应该去开市客囤点什么,光是橡胶手套、消毒液、消毒纸巾之类的就列了十几样。在吃的东西上,美国人囤的较多的主要是容易保存的罐头食品、意大利面条、瓶装水等。数据显示,开市客今年2月的销售额较去年同期上涨了12.4%。开市客认为其中至少有3%的上涨与疫情有关。

随着迪庆经济的发展,以青稞为原料可以生产各种青稞酒、青稞食品。香格里拉青稞已成为迪庆经济发展的重要经济作物。(完)

当前美国正处于总统选举党内预选的决战阶段,民主党参选人拜登和桑德斯10日同时宣布,受到疫情影响,取消两人当天晚间原定在俄亥俄州克利夫兰举行的集会。这是2020年美国总统预选中第一次因为对新冠肺炎疫情而取消竞选集会。

美国疫情严重地区的一些原定大型公众聚集活动已经推迟或取消。以纽约为例,纽约路跑协会原定3月15日在纽约举办的半马在10日宣布取消。同一天,有100多年历史的纽约国际车展宣布推迟举办,从原定的4月10日推迟到8月28日。

■本报驻联合国记者 贾泽驰

位于纽约的哥伦比亚大学3月9日和10日两天停课。从3月11日起开始改为在线教学。纽约大学3月10日宣布,从3月11日起改上网课,直至3月下旬。位于加州的斯坦福、南加大等学校已经早于美东的大学暂停了课堂授课,改上网课。

纽约州10日宣布,对该州西切斯特郡的新罗谢尔市实行管制,创下了美国在此次疫情中“封城”的先河。

在洛杉矶、纽约等华人较多的地方,华人超市里出现了抢购大米、方便面和食用油等物资的情况。一些超市墙角平时堆积如山的大米都被拿空了,美国本土的一种6.8公斤一袋的大米尤其受欢迎。由于物资有限,个别超市还出台了临时“土政策”,比如购物20美元以上才可以买米,每人限购2袋大米等。其他物资方面,华人买得较多的还是口罩,口罩价格也是一飞冲天。3月初纽约曼哈顿唐人街某超市一盒50个普通医用口罩的价格达到了195美元。